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微生物存在于人體、植物、土壤、海洋等各種環(huán)境中，這些微生物群落的集合被稱為微生物組。當(dāng)今這個時代人類面臨的挑戰(zhàn)，包括養(yǎng)活眾多的人口、生產(chǎn)可持續(xù)的能源、保護(hù)環(huán)境或減緩對環(huán)境的破壞，以及人類健康，都與微生物相關(guān)，可以從微生物世界中找到解決方案。

最近幾十年來，人們逐漸認(rèn)識到，從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)到氣候變化，從人類健康問題到河流海洋污染等環(huán)境問題，或多或少都與微生物組相關(guān)聯(lián)。鑒于微生物組對人類與環(huán)境健康的重要性，很多發(fā)達(dá)國家正在極力推進(jìn)“國際微生物組計劃”，致力研究微生物在健康、農(nóng)業(yè)、環(huán)境、生態(tài)等方面的應(yīng)用。

微生物治理，簡而言之即利用微生物的功能特性進(jìn)行水污染治理。水生態(tài)修復(fù)涵蓋“生態(tài)”和“修復(fù)”兩個概念，即覺得水生態(tài)修復(fù)不僅僅是水質(zhì)的凈化或者污染物的祛除，“生態(tài)”成分異常重要。對于河道而言，沒有“生態(tài)”的水體不能稱之為自然水體，“生態(tài)”是一個概念，具體到物象化即指：微生物、浮游生物、底棲類動物、魚、蝦、水生植物等方方面面，它們共同構(gòu)成了水環(huán)境的“生態(tài)系統(tǒng)”，其中微生物是整個生態(tài)系統(tǒng)的根據(jù)，沒有微生物，生態(tài)即不完整，如大樓沒有地基，上層建筑隨可能坍塌。因此，出于微生物的重要性考慮，運用微生物的技術(shù)工藝可以說是在水生態(tài)系統(tǒng)治理中唯一正確的技術(shù)方向。

根據(jù)微生物治理技術(shù)的運用手段不同，大致分為以下集中技術(shù)：

1、經(jīng)實驗室馴化的微生物直接潑灑——選擇需要的工程菌投加如何，直接降解污染物；

2、水生植物——利用植物生物特性，輔助水體微生物生長，輔助生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)建；

3、曝氣增氧技術(shù)——增加水體溶解氧，改善水體生存環(huán)境，催生部分耗氧微生物生長，為微生物生長提供良好的生存環(huán)境，通過微生物修復(fù)水生態(tài)；

4、土著微生物馴化技術(shù)——利用先進(jìn)的技術(shù)工藝，如：生物酶、營養(yǎng)源、微生物反應(yīng)平臺等，在河道內(nèi)直接催化土著有益微生物，通過所催化的微生物降解污染物，構(gòu)建水生態(tài)系統(tǒng)；

5、其它微生物工藝。